Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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