Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SEC23BQ15437 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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