Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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