Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms