Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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