Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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