Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GRIK2Q13002 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK2Q13002 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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