Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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