Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms