Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms