Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms