Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MC1RQ01726 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.6 ms