Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms