Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms