Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK17Q00537 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms