Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms