Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL23P55773 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL23P55773 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL23P55773 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL23P55773 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL23P55773 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL23P55773 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL23P55773 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms