Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSE1LP55060 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSE1LP55060 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms