Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HCCSP53701 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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