Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8P50990 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8P50990 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms