Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms