Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms