Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MLH1P40692 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MLH1P40692 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MLH1P40692 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms