Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETFBP38117 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms