Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJB2P29033 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms