Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.8 ms