Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AMY2BP19961 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms