Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EGR1P18146 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EGR1P18146 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms