Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ESRRAP11474 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ESRRAP11474 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ESRRAP11474 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms