Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM225BP0DP42 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms