Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETSIPP0DME0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms