Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGGP02679 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGGP02679 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGGP02679 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms