Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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