Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PHF1O43189 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PHF1O43189 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PHF1O43189 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PHF1O43189 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PHF1O43189 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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