Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.6 ms