Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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