Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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