Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms