Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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