Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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USP35Q9P2H5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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