Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HCN3Q9P1Z3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms