Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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