Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms