Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC17Q9NVM6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms