Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms