Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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