Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG4Q9H9E3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms