Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CEP295Q9C0D2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms