Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC13A1Q9BZW2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms