Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms